يجهّز الطباخ مقادير الشكشوكة بالفلفل الرومي كما يلي: البيض 4 حبات، البصل حبة صغيرة مفرومة ناعماً، الطماطم 3 حبات مبشورة أو مفرومة ناعماً، الفلفل الرومي الأخضر نصف حبة مقطع شرائح (اختياري). الثوم فصان مفرومان، زيت الزيتون 2 ملاعق كبيرة، الملح حسب الرغبة، الفلفل الأسود نصف ملعقة صغيرة، الكمون ربع ملعقة صغيرة (اختياري)، والفلفل الأحمر نصف ملعقة صغيرة (حلو أو حار / اختياري)، والبقدونس حسب الرغبة مفروماً للتزيين. تضمن هذه المقادير توازن النكهات وتناسب الخبز الطازج.
يُسخّن زيت الزيتون في مقلاة على نار متوسطة، ثم يُضاف البصل ويُقلّب حتى يذبل. ثم يُضاف الثوم والفلفل الأخضر ويُقلّبان لمدة دقيقة، ثم تُضاف الطماطم مع البهارات الملح والفلفل الأسود والكمون والفلفل الأحمر. يُترك المزيج على نار هادئة لمدة 5–7 دقائق حتى يتكاثف. يُكسَر البيض فوق الصلصة بحذر، وتُغطّى المقلاة لمدة 5 دقائق أو حتى ينضج البيض حسب الرغبة. يُزيّن بالبقدونس المفروم وتُقدَّم الشكشوكة ساخنة مع الخبز الطازج.
