يجهز الشيف مكونات الشكشوكة في الفرن بعناية قبل البدء. تشكل هذه المكونات الأساس لصنف يوازن بين النكهات ويعتمد على مكونات بسيطة وجيدة الجودة. ويختار الشيف فليفلة خضراء مقطعة أو حمراء، ثم يضيف فصين من الثوم المهروس، واثنتين من ملاعق زيت الزيتون، ويرش الملح والفلفل الأسود والبابريكا حسب الرغبة، ويضيف ملعقة كبيرة من البقدونس المفروم للتزيين.
يقوم الشيف بتسخين زيت الزيتون في مقلاة ثم يضيف البصل المفروم ويشوحه حتى يذبل. بعدها يضيف الفليفلة والثوم ويقلبهما لمدة دقيقة، ثم يضيف الطماطم المهروسة ويتبل الخليط بالملح والفلفل الأسود والبابريكا. يترك الخليط يغلي ليكثف لمدة خمس دقائق ثم يصب في صينية فرن مناسبة، ويصنع الشيف أربع فجوات ويفتّح فيها البيض قبل إدخاله إلى الفرن المسخن مسبقًا عند 180 مئوية لمدة 10–12 دقيقة حتى ينضج البيض.
